在这种情况下，甲方可以通过以下步骤来保护自身的合法权益：
首先，甲方应仔细审查与乙方签订的合同条款，特别是关于付款、违约责任、争议解决等方面的规定。确认合同中是否有明确约定资金到账后的使用方式、还款期限以及违约责任。
保留证据：
甲方应保留所有与合同履行相关的证据，包括但不限于合同文本、付款凭证、双方沟通记录等，以证明资金已经按照合同约定支付给乙方。
法律途径：
a. 发送律师函：首先，甲方可以发送律师函给乙方和丙，要求其立即归还扣留的资金，并明确告知违约的法律后果。
b. 提起诉讼：如果发送律师函后，乙方和丙仍未归还资金，甲方可以向人民法院提起诉讼，要求乙方和丙承担违约责任，并请求法院判决其归还资金。
由于丙是乙方的法定代表人，其行为可能代表乙方的行为。因此，甲方在诉讼中可以要求丙承担个人责任，特别是如果丙的行为构成个人欺诈或滥用职权。
财产保全：
在诉讼过程中，如果担心乙方和丙可能转移或隐匿财产，甲方可以申请法院采取财产保全措施，如查封、冻结乙方的财产，以保障诉讼请求的实现。
合同解除：
如果乙方和丙的行为严重违反合同约定，甲方还可以考虑解除合同，并要求乙方承担违约责任。
咨询专业律师：
以下是一些建议：
请注意，以上建议仅供参考，具体操作还需根据实际情况和法律规定进行调整。
提醒：未面谈及查看证据材料，律师回答仅供参考。
请问，办理不动产抵押登记手续后，抵押权人的法定代表人发生变更，对抵押权是否有影响？……
我从公司承包了一批零件回来加工 交了四万的定金公司要求合格率最低百分之五十 我做完之后他叫我把产品寄到了公司验收 东西到公司放了20天……
新公司劳动合同里劳动报酬这一项，写的是甲乙双方约定工资按所在单位年度绩效考核办法执行，但是给的offer里写了具体的年薪，如果公司此后降低薪……
乙方未按规定向甲方提出辞职或者擅自离职情形的 甲方在乙方办理交接工作后支付乙方的当月工资和办理相关的离职手续 急辞的话是当天结清工资还是……
合同规定，乙方解除本合同需提前7个工作日通知甲方。若乙方非因前款所述原因提前解除合同，给甲方造成其他损失的，应据实赔偿。此外，本合同终止或解……
您好！甲方在合同期结束后才告知乙方不再续签合同，致使乙方找工作困难，乙方是否能获得赔偿？……
我妈妈帮她的一个朋友乙在信用社代了5万块钱，乙方签定了借条和到期偿还的协议，现代款到期，乙无力偿还，跑了。而信用社准备起诉我妈妈，我妈作为直……
甲方未按合同规定为乙方购买保险长达近半年，请问甲方算不算是违约？如果是，乙方有无权力申请解除合同？……
租赁合同约定：本合同期满后，甲方继续出租，乙方在同等条件下，有优先承租权；本合同期满，乙方如需续租，需提前两个月提出书面申请，并签订合同，否……
合同中约定：3 、 在本合同没有其他约定的情况下 ， 服务期限届满 ， 乙方因甲方原因仍未顺利通过职称评审的， 乙方可向甲方申请退费，甲方在……